
Tehnološki postupci u preradi organskih proizvoda odvijaju se u kontinuitetu i bez mešanja sa sastojcima i proizvodima iz konvencionalne proizvodnje. Ukoliko se paralelno sa konvencionalnom linijom želi proizvoditi i organska linija proizvoda, celokupan postupak prerade mora biti odvojen u vremenu ili prostoru od tehnoloških postupaka konvencionalne proizvodnje namirnica. Takođe, neophodno je da sva mašinska oprema bude očišćena dozvoljenim sredstvima pre prerade organskih proizvoda. Mešanje organskih i konvencionalnih proizvoda striktno je zabranjeno, a takođe, sirovine se moraju skladištiti odvojeno ukoliko se subjekat bavi preradom i konvencionalne sirovine.
Mogu se korisititi i samo određeni poljoprivredni sastojci koji nisu dobijeni metodama organske proizvodnje, navedeni u prilogu pravilnika. U preradi sirovina organskog porekla mogu se koristiti samo određeni aditivi, pomoćne supstance, arome, minerali i druge hranljive materije dozvoljene u organskoj proizvodnji, navedeni u prilogu pravilnika.
Verodostojna sertifikacija i obeležavanje kako primarnih tako i gotovih proizvoda važni su za potrošača, kako bi bio u stanju da razlikuje autentične organske proizvode.